Hallo
wenn ich dich soweit richtig verstanden habe, dann könnte ich mir vorstellen das du mit "Seiten verschieben" das gewünschte Ergebnis hinbekommen solltest.
Also die Seiten aus den Projektordnern, an die gewünschte Stelle im ZP verschieben.
Danach dann sollten die Ordner leer sein, und diese kannst du dann löschen.
http://docs.zeta-producer.com/seiten-verschieben.html
Danach dann aber das Projekt überprüfen,l ob alle "Verlinkungen" noch stimmen.
Mach aber sicherheitshalber zuvor ein Backup des Projektes, falls dabei was schief gehen sollte, oder dies so nicht funktionieren sollte.