Hallo Jochen,
direkt in Zeta kannst Du die .htaccess nicht bearbeiten. Die Rules von Zeta werden an eine vorhandene .htaccess angehangen. Das beste Vorgehen wäre, die .htaccess per filezilla runterladen und zu bearbeiten, wieder hochladen, testen. Weitere Bearbeitungen an der .htaccess immer nur mit der Online-Variante machen. Wenn Du nicht zu viele Dateinamen umbenannt hast, ist es eventuell übersichtlicher, wenn Du auf die von Zeta erstellten Rules verzichtest (URL-Rewrite=kein) und die Änderungen manuell in der .htaccess einträgst.
PS: Handgeschrieben lassen sich wunderbar Strukturen entwickeln (mit Leerzeilen) sowie die einzelnen Einträge sinnvoll kommentieren. Ist zwar mehr Arbeit, aber insbesondere dann interessant, wenn irgendwann einmal auch jemand anders die Betreuung der Homepage übernehmen sollte.